pandas100个骚操作:JSON自动解析为DataFrame

共 3487字,需浏览 7分钟

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2021-02-09 20:33



来源:Python数据科学

作者:东哥起飞

大家好,我是你们的东哥。

本篇是pandas100个骚操作的第2篇:JSON自动解析为DataFrame

全部内容请点文章头部的「pandas100个骚操作」系列查看。


调用API和文档数据库会返回嵌套的JSON对象,当我们使用Python尝试将嵌套结构中的键转换为列时,数据加载到pandas中往往会得到如下结果:

df = pd.DataFrame.from_records(results [“ issues”],columns = [“ key”,“ fields”])
说明:这里results是一个大的字典,issues是results其中的一个键,issues的值为一个嵌套JSON对象字典的列表,后面会看到JSON嵌套结构。
问题在于API返回了嵌套的JSON结构,而我们关心的键在对象中确处于不同级别。
嵌套的JSON结构张成这样的。
而我们想要的是下面这样的。
下面以一个API返回的数据为例,API通常包含有关字段的元数据。假设下面这些是我们想要的字段。
  • key:JSON密钥,在第一级的位置。

  • summary:第二级的“字段”对象。

  • status name:第三级位置。

  • statusCategory name:位于第4个嵌套级别。

如上,我们选择要提取的字段在issues列表内的JSON结构中分别处于4个不同的嵌套级别,一环扣一环。
{
  "expand""schema,names",
  "issues": [
    {
      "fields": {
        "issuetype": {
          "avatarId"10300,
          "description""",
          "id""10005",
          "name""New Feature",
          "subtask": False
        },
        "status": {
          "description""A resolution has been taken, and it is awaiting verification by reporter. From here issues are either reopened, or are closed.",
          "id""5",
          "name""Resolved",
          "statusCategory": {
            "colorName""green",
            "id"3,
            "key""done",
            "name""Done",
          }
        },
        "summary""Recovered data collection Defraglar $MFT problem"
      },
      "id""11861",
      "key""CAE-160",
    },
    {
      "fields": { 
... more issues],
  "maxResults"5,
  "startAt"0,
  "total"160
}


一个不太好的解决方案

一种选择是直接撸码,写一个查找特定字段的函数,但问题是必须对每个嵌套字段调用此函数,然后再调用.apply到DataFrame中的新列。
为获取我们想要的几个字段,首先我们提取fields键内的对象至列:
df = (
    df["fields"]
    .apply(pd.Series)
    .merge(df, left_index=True, right_index = True)
)

从上表看出,只有summary是可用的,issuetype、status等仍然埋在嵌套对象中。
下面是提取issuetype中的name的一种方法。
# 提取issue type的name到一个新列叫"issue_type"
df_issue_type = (
    df["issuetype"]
    .apply(pd.Series)
    .rename(columns={"name""issue_type_name"})["issue_type_name"]
)
df = df.assign(issue_type_name = df_issue_type)


像上面这样,如果嵌套层级特别多,就需要自己手撸一个递归来实现了,因为每层嵌套都需要调用一个像上面解析并添加到新列的方法。
对于编程基础薄弱的朋友,手撸一个其实还挺麻烦的,尤其是对于数据分析师,着急想用数据的时候,希望可以快速拿到结构化的数据进行分析。
下面东哥分享一个pandas的内置解决方案。

内置的解决方案

pandas中有一个牛逼的内置功能叫 .json_normalize。
pandas的文档中提到:将半结构化JSON数据规范化为平面表。
前面方案的所有代码,用这个内置功能仅需要3行就可搞定。步骤很简单,懂了下面几个用法即可。
  • 确定我们要想的字段,使用 . 符号连接嵌套对象。
  • 将想要处理的嵌套列表(这里是results["issues"])作为参数放进 .json_normalize 中。
  • 过滤我们定义的FIELDS列表。
FIELDS = ["key""fields.summary""fields.issuetype.name""fields.status.name""fields.status.statusCategory.name"]
df = pd.json_normalize(results["issues"])
df[FIELDS]


没错,就这么简单。


其它操作

记录路径

除了像上面那样传递results["issues"]列表之外,我们还使用record_path参数在JSON对象中指定列表的路径。
# 使用路径而不是直接用results["issues"]
pd.json_normalize(results, record_path="issues")[FIELDS]

自定义分隔符

还可以使用sep参数自定义嵌套结构连接的分隔符,比如下面将默认的“.”替换“-”
# 用 "-" 替换默认的 "."
FIELDS = ["key""fields-summary""fields-issuetype-name""fields-status-name""fields-status-statusCategory-name"]
pd.json_normalize(results["issues"], sep = "-")[FIELDS]

控制递归

如果不想递归到每个子对象,可以使用max_level参数控制深度。在这种情况下,由于statusCategory.name字段位于JSON对象的第4级,因此不会包含在结果DataFrame中。
# 只深入到嵌套第二级
pd.json_normalize(results, record_path="issues", max_level = 2)
下面是.json_normalize的pandas官方文档说明,如有不明白可自行学习,本次东哥就介绍到这里。
参考:
[1] pandas官方文档:https://pandas.pydata.org/pandas-docs/stable/reference/api/pandas.json_normalize.html
[2] https://medium.com/swlh/converting-nested-json-structures-to-pandas-dataframes-e8106c59976e
以上所有代码已上传至我的GitHub:
项目链接:https://github.com/xiaoyusmd/PythonDataScience
原创不易,如果觉得有帮助,支持下给个Star


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