R统计和作图文章汇总

R统计和作图

• 这个为生信学习和生信作图打造的开源R教程真香！！！

• 文章用图的修改和排版 (1)

• 文章用图的修改和排版 (2)

• ggplot2高效实用指南 (可视化脚本、工具、套路、配色)

• 在B站学习大名鼎鼎的StatQuest 系列统计和生信分析视频（中文字幕）- 也见证助理教授到创业者的华丽转身

• 使用R语言的正确姿势，R包干货奉献

• 用rmarkdown定制你的数据分析报告

• 高颜值免费在线绘图工具升级版来了~~~

• 简单强大的在线绘图

• 简单强大的在线绘图-升级版

• 简单强大的在线绘图-第3版

• 超详细的热图绘制教程(5000余字)，真正的保姆级教程

• R」ggplot2拼图包patchwork推荐与使用

• 高通量数据中批次效应的鉴定和处理 - 系列总结和更新

• 论文图表基本规范

• 学术图表的基本配色方法

• 数据可视化基本套路总结

• Graphpad，经典绘图工具初学初探

• 你的包佩奇了吗？试试新版Rstudio，自动提醒缺失包！

• 原来Rstudio还可以这么使用，又方便了一些

• 在R中赞扬下努力工作的你，奖励一份CheatShet

• 别人的电子书，你的电子书，都在bookdown

• R语言 - 入门环境Rstudio

• R语言 - 热图绘制 (heatmap)

• R语言 - 基础概念和矩阵操作

• R语言 - 热图简化

• R语言 - 热图美化

• R语言 - 线图绘制

• R语言 - 线图一步法

• R语言 - 箱线图（小提琴图、抖动图、区域散点图）

• R语言 - 箱线图一步法

• R语言 - 火山图

• R语言 - 富集分析泡泡图

• R语言 - 散点图绘制

• R语言 - 韦恩图

• R语言 - 柱状图

• R语言 - 图形设置中英字体

• R语言 - 非参数法生存分析

• R语言 - 绘制seq logo图

• WGCNA分析，简单全面的最新教程

• psych +igraph：共表达网络构建

• 245热图展示微生物组的物种和功能丰度或有无、距离矩阵

• 一文学会网络分析——Co-occurrence网络图在R中的实现

• 一文看懂PCA主成分分析

• 主成分分析PCA

• 放弃Venn-Upset-花瓣图，拥抱二分网络

• 富集分析DotPlot，可以服

• Volcano plot | 别再问我这为什么是火山图

• 图形解读系列 | 散点图也不简单

• 总被审稿人提起的多重假设检验校正是什么？

• 基因共表达聚类分析和可视化

• R中1010个热图绘制方法

• 还在用PCA降维？快学学大牛最爱的t-SNE算法吧, 附Python/R代码

• 一个函数抓取代谢组学权威数据库HMDB的所有表格数据

• 文章用图的修改和排版

• network3D: 交互式桑基图

• network3D 交互式网络生成

• Seq logo 在线绘制工具——Weblogo

• 生物AI插图素材获取和拼装指导

• 如何使用AI进行SCI组图

• 如何使用AI画一个简单的细胞通路图?

• 一分钟绘制磷脂双分子层：AI零基础入门和基本图形绘制

• AI科研绘图（二）：模式图的基本画法

• 图像处理R包magick学习笔记

• SOM基因表达聚类分析初探

• 利用gganimate可视化全球范围R-Ladies（R社区性别多样性组织）发展情况

• 你知道R中的赋值符号箭头(<-)和等号（=）的区别吗？

• R语言可视化学习笔记之ggridges包

• 利用ComplexHeatmap绘制热图(一)

• ggplot2学习笔记之图形排列

• R包reshape2，轻松实现长、宽数据表格转换

• 用R在地图上绘制网络图的三种方法

• PCA主成分分析实战和可视化 附R代码和测试数据

• iTOL快速绘制颜值最高的进化树！

• 12个ggplot2扩展包帮你实现更强大的可视化

• 编程模板-R语言脚本写作：最简单的统计与绘图，包安装、命令行参数解析、文件读取、表格和矢量图输出

• R语言统计入门课程推荐——生物科学中的数据分析Data Analysis for the Life Sciences

• 数据可视化基本套路总结

• 你知道R中的赋值符号箭头<-和等号=的区别吗？

• 使用dplyr进行数据操作30例

• 交集intersect、并集union、找不同setdiff

• R包reshape2，轻松实现长、宽数据表格转换

• 1数据类型（向量、数组、矩阵、 列表和数据框）

• 2读写数据所需的主要函数、与外部环境交互

• 3数据筛选——提取对象的子集

• 4向量、矩阵的数学运算

• 5控制结构

• 6函数及作用域

• 7认识循环函数lapply和sapply

• 8分解数据框split和查看对象str

• 9模拟—随机数、抽样、线性模型

• 1初识ggplot2绘制几何对象

• 2图层的使用—基础、加标签、注释

• 3工具箱—误差线、加权数、展示数据分布

• 4语法基础

• 5通过图层构建图像

• 6标度、轴和图例

• 7定位-分面和坐标系

• 8主题设置、存储导出

• 9绘图需要的数据整理技术

• 创建属于自己的调色板

• 28个实用绘图包，总有几个适合你

• 热图绘制

• R做线性回归

• 绘图相关系数矩阵corrplot

• 相关矩阵可视化ggcorrplot

• 绘制交互式图形recharts

• 交互式可视化CanvasXpress

• 聚类分析factoextra

• LDA分析、作图及添加置信-ggord

• 解决散点图样品标签重叠ggrepel

• 添加P值或显著性标记ggpubr

• Alpha多样性稀释曲线rarefraction curve

• 堆叠柱状图各成分连线画法：突出组间变化

• 冲击图展示组间时间序列变化ggalluvial

• 桑基图riverplot

• 微生物环境因子分析ggvegan

• 五彩进化树与热图更配ggtree

• 多元回归树分析mvpart

• 随机森林randomForest 分类Classification 回归Regression

• 加权基因共表达网络分析WGCNA

• circlize包绘制circos-plot

• R语言搭建炫酷的线上博客系统

• 维恩(Venn)图绘制工具大全 （在线+R包）

• R包circlize：柱状图用腻了？试试好看的弦状图

• 获取pheatmap聚类后和标准化后的结果

• 聚类热图怎么按自己的意愿调整分支的顺序？

• 增强火山图，要不要试一下？

• esquisse: 快速可视化图形的 Rstudio 插件

• 一个震撼的交互型3D可视化R包 - 可直接转ggplot2图为3D

• 赠你一只金色的眼 - 富集分析和表达数据可视化

• 是Excel的图，不！是R的图

• 道友，来Rstudio里面看动画了

• 用了这么多年的PCA可视化竟然是错的！！！

• 主成分分析PCA

• 万能转换：R图和统计表转成发表级的Word、PPT、Excel、HTML、Latex、矢量图等

• 2019年诺贝尔生理医学奖揭晓 |动图展示历年生理学奖

• 2019年诺贝尔化学奖揭晓 |八一八，那些年的诺贝尔化学奖

• cellassign：用于肿瘤微环境分析的单细胞注释工具（9月Nature）

• ggThemeAssist｜鼠标调整主题，并返回代码

• ggcor |相关系数矩阵可视化

• 这也太简单了吧！一个函数完成数据相关性热图计算和展示

• ggcor在微生物生态领域的使用实战

• 画图手册 | ImageGP：今天你“plot”了吗？

• R语言一键批量完成差异统计和可视化

• gggenes绘制多物种基因结构比较

• 数据可视化完美指南-R-python

• Pathview包：整合表达谱数据可视化KEGG通路

• Matplotlib绘制的27个常用图(附对应代码实现)

• 让你的单细胞数据动起来！|iCellR(一)

• 让你的单细胞数据动起来！|iCellR(二)

• Celaref | 单细胞测序细胞类型注释工具

• SCENIC | 从单细胞数据推断基因调控网络和细胞类型

• R变量索引 - 什么时候使用 @或$

• 手把手重现Science的主图Maptree

• 可视化之为什么要使用箱线图？

• Alpha多样性箱线图(样章，11图2视频)

• 学会这个BBC，你的图也可以上新闻啦！

• ggplot2 图区域放大

• iheatmapr包：可交互的热图绘制方法

• 图形解读系列 | 给你5个示例，你能看懂常用热图使用吗？

• 这个R包自动注释单细胞数据的平均准确率为83％，使用后我的结果出现了点问题|附全代码

• 一个R包完成单细胞基因集富集分析 （全代码）

• 新版QQ自带的截图工具太强了，截取长图、截图钉在桌面上、图形中文字识别、马赛克标记、序号自动生成！