赵书红（女科学家）-轻识

人物经历

学习经历

1985.9-1989.6内蒙古民族大学学习并获学士学位

1989.9-1992.6吉林农业大学动物遗传育种专业学习并获硕士学位

1995.9-1998.6东北农业大学动物科技学院学习（为华中农业大学定向培养的在职博士研究生），获动物遗传育种专业博士学位

教学工作

1992年8月，赵书红硕士毕业来到华中农业大学工作。

1992.7-1995.7华中农业大学畜牧兽医系助教

1995.9-1998.11华中农业大学讲师

1998.12-2003.10 华中农业大学畜牧兽医学院副教授,动物遗传育种部副主任,分子生物学与育种实验室副主任

2003.11--华中农业大学动物科技学院教授

动物遗传育种系主任(2005.8--)

留学经历

2000.7-2001.7美国依阿华州立大学动物科学系分子遗传组访问学者

2001.11-2005.5 美国依阿华州立大学动物科学系分子遗传组合作研究

主要兼职：

农业动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室主任、学术委员会委员

中国畜牧兽医学会动物遗传育种学分会副秘书长

中国畜牧兽医学会动物遗传标记分会理事

湖北省外专局引智项目评审委员会专家组成员

国际动植物基因组大会组委会主席团成员(2008-2010) (Animals: Hans Cheng, Joan Lunney, James Reecy, Max Rothschild, Shu-Hong Zhao)

国际动物遗传研究会（International Society of Animal Genetics）会员

美国动物科学学会（American Society of Animal Science）会员

《Research Journal of Animal Sciences》、《猪业科学》杂志编委，《BMC Genomics》、《BBA-Gene Regulatory Mechanisms》、《Animal Genetics》、《Biochemical Genetics》、《中国科学》、《遗传学报》、《畜牧兽医学报》等杂志审稿人

科研工作

1989-1992年：在吉林农业大学动物科技系从事松毛虫赤眼蜂的选择杂交试验与计算机模拟研究及蛋白质多态性检测并获得硕士学位。

1992-1995年：华中农业大学工作，作为主要负责人之一组建了动物分子生物学与育种实验室。作为2项国家自然科学基金的主要完成人，承担了血样DNA提取以及猪的GH、PRKAR1A等基因的PCR-RFLP与PCR-SSCP检测工作。

1995-1998年：作为霍英东青年教师基金项目的主要完成人，在国内外首次在猪中建立单精子分型遗传作图技术并利用我室在江苏常熟畜牧良种场合作建立的参考家系表型与DNA信息完成了猪12号染色体上几个微卫星座位的高精度遗传图的构建，提高了遗传图精度，获得博士学位。

1998-2006年：先后主持承担了20余项科研项目，其中国家自然科学基金5项（批准号为39770539、30100131、30571328、30671138、U0631005）：4个国家基金面上项目和1项重点项目，1项“十一五”“863”课题，2项国际科学基金（International Foundation for Science, IFS，课题编号：B2580/1,B2580/2）、1项国际原子能机构项目。作为主要学术骨干参与承担了“973”项目“农业动物遗传资源的分子标记评估及其优质基因的分离和利用研究”（2001-2005）、“重要复杂性状的比较基因组”（2006-2008）的研究工作。

2005年牵头申请湖北省自然科学基金创新群体并获得资助，牵头申请了农业动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室，并于2005年12月获得教育部批准。2005年入选教育部新世纪优秀人才支持计划,2006年入选“新世纪百千万人才工程”国家级人选。

2009年至2011年，应邀担任国际动植物基因组大会动物基因组组委会主席团成员。

与美国依阿华州立大学动物分子遗传组Christopher K Tuggle教授合作制备了猪尼龙膜cDNA芯片用于肌肉发育研究；受Affymetrix公司委托检测了其设计的猪基因芯片并应用于猪胚胎发育基因表达差异研究；参与了美国猪基因组计划协调人带领的猪寡核苷酸芯片开发与利用；与美国动物基因组数据库负责人Zhiliang Hu博士进行了猪基因组生物信息学方面的合作，将1300个在沙门氏菌感染猪肺脏差异表达的基因定位在了猪的染色体上，部分基因与免疫性状定位的QTL区域吻合，可作为位置候选基因进一步研究；与韩国忠北大学学者合作进行了猪肌肉生长相关基因的研究；通过这些工作建立了猪高通量基因表达研究技术平台，促进了猪功能基因组学研究水平的提高。与依阿华州立大学Tuggle教授（Professor, Molecular genetics; Chair, Bioinformatics & Computional Biology）实验室、美国猪基因组计划协调人Rothschild实验室建立了长期稳定的合作关系，合作申请了国家自然科学基金，先后派去3名教师/博士进行合作科研，在试验猪群体共享、基因功能分析、生物信息学、基因芯片应用等方面均取得了一系列研究成果，合作申请专利一项，合作发表文章10篇。

主持了两项国际科学基金（IFS）项目，1项国际原子弹机构项目,最早开展了将微卫星标记用于中国山羊遗传多样性评估研究，与国际原子能机构动物生产处、联合国粮农组织国际家畜研究所、芬兰农业科学院等单位建立了良好合作关系，先后派两名年轻教师至肯尼亚国际家畜研究所进行短期科研，一名博士到芬兰农业科学院做博士后研究。

2018年，赵书红教授领衔的研究团队历时近14年，完成了“猪整合组学基因挖掘技术体系建立及其育种应用”科技成果，荣获2018年度国家技术发明奖二等奖。该成果突破了猪基因组学研究方法和工具数量不足、效率不高的局限，构建了首个猪整合组学数据库，涵盖基因组、转录组、表观组、表型组等多组学信息；开发了GWAS新算法等10个方法和工具；结合机器学习开发出基于“多组学联动评分”的整合组学基因挖掘技术体系，发掘出一批新分子育种标记；制定出1套适用于优质猪母本选育的综合选择指数，培育出1个优质猪母本新品系，筛选出2个三元杂优配套组合；选育了“硒都黑”猪新品种，获批开展中间试验，恩施黑猪肉获国家地理标志保护产品证书。该项目在猪多组学分析方法与工具创新、猪整合组学基因挖掘技术体系创建等方面取得重要进展，丰富了猪种质创新方法，有力地推动了猪分子育种技术的发展。

教学工作

承担的教学任务：主讲本科生的《家畜育种学》(每学年授课学时数为50)、《分子生物学》(每学年授课学时数为40)，研究生《分子生物学》（48学时）、曾讲授函授生的《家畜育种学》及一部分研究生的《动物育种专论》(40学时)、《分子生物学实验操作技术》，曾部分讲授本科生《猪的遗传改良》、《生物统计附试验设计》、《专业英语》等课程。在教学中态度认真，刻苦钻研教学内容，讲课中概念清楚，内容充实，能反映本学科最新进展，注意教书育人，受到学生好评，曾获全校青年教师讲课竞赛优胜奖。在教材编写方面：（1）参编面向21世纪教材《普通遗传学》（高等教育出版社,2001,2万字），（2）参编面向21世纪教材《分子遗传学》（中国农业出版社,2001,8万字），（3）参编“十五”规划教材《家畜育种学》（中国农业出版社，3万字，2007），（4）参编面向21世纪教材《动物遗传学》（高等教育出版社，出版中），（5）主编面向21世纪教材《分子生物学》（高等教育出版社，编写中）。在教学改革方面，主持动物遗传育种教学团队项目，主持并完成了校教学项目《家畜育种学CAI课件制作》。获华中农业大学1999、2006年度教学比赛优胜奖及优秀学生论文指导奖。指导大学生两次获得湖北省大学生优秀毕业论文一等奖。指导的大学生SRF项目“猪microRNA分离研究”获得湖北省大学生课外科技作品特等奖，一篇论文“猪miR-206前体的克隆、表达及生物信息学分析”发表在畜牧兽医学报接受，另有一篇发表在SCI收录的亚澳动物科学杂志。

人物成就

科研项目

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undefined：完成

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undefined：完成

学术会议

（1）2007年10月主持了在华中农业大学举行的联合国原子能机构的亚洲小反刍动物的项目协调会。

（2）2007年10月主持了在华中农业大学举行的全国动物遗传育种学术讨论会。

（3）2006年9月作为中国方面项目负责人参加在韩国举行的联合国原子能机构组织的亚洲小反刍动物项目协调会。

（4）2006年9月参加在韩国举行的亚洲动物科学会议，韩国基因组会议，并在韩国基因组会议上做了不同猪种子宫内膜的转录谱差异的发言。

（5）2005年9 月被邀请出席在哈尔滨召开的黑龙江国际生物技术峰会（International Agro-Biotechnology Conference, Heilongjiang, China ），并在大会上作题为“Transcriptional profiling in the pig using oligonucleotide microarrays”的特邀报告。

（6）2005年8月出席在哈尔滨召开的第十三次全国动物遗传育种学术讨论会，并在大会上作题为“基因芯片技术在猪功能基因组学研究中的应用”的大会报告。

（7）2005年1月出席在美国圣地亚哥召开的第十三次国际动植物基因组会议（Plant & Animal Genome XIII Conference），并在分会上作题为“Transcriptional profiling in normal tissues and Salmonella choleraesuis infected lung using the porcine 70mer oligo array”的报告。

（8）2004年1月出席在美国圣地亚哥召开的第十二次国际动植物基因组会议（Plant & Animal Genome XII Conference），并作墙报展示。

（9）2003年1月出席在美国圣地亚哥召开的第十一次国际动植物基因组会议（Plant & Animal Genome XI Conference），并作墙报展示。

学术获奖

猪重要基因资源和分子标记的发掘、鉴定及功能研究，湖北省自然科学二等奖，2006，排名第二。

猪重要基因资源及比较转录组研究,教育部高等学校科学技术奖（自然科学二等奖）,2006, 排名第二。

微卫星DNA的克隆、测序、定位及与经济性状的关系和在猪遗传多样性中的应用，获湖北省自然科学三等奖，2002，(李奎、赵书红、刘榜、余梅、樊斌)。

指导的硕士论文“猪FBXO32基因的分离、定位、多态性检测及与经济的关联分析”获湖北省优秀硕士论文奖。

主要作品

专利情况

（1）获得国家发明专利授权3项：

1）适用于猪品种分类的猪微卫星DNA标记，专利授权号：ZL011064773，国际专利分类号：C12N15/12， 2004。完成人: 李奎、彭中镇、龚炎长、赵书红、刘榜、余梅、熊统安

2）猪背膘厚PSME3基因及其制备方法, 专利授权号：ZL 03156242.6，2006。完成人：李奎、余梅、刘榜、熊统安、赵书红、潘佩文、王彦芳、朱猛进、樊斌

3）猪断奶重PSME1基因及其制备方法, 专利授权号：ZL03156241.8，2006。完成人：李奎、王彦芳、余梅、刘榜、潘佩文、熊统安、樊斌、赵书红

（2）申请发明专利5项（3项国内，1项国际，1项美国）：

1）猪肉质性状基因FOXO3A的克隆及其应用,。完成人：赵书红、于晶、朱猛进、李奎、刘榜、樊斌、余梅、李长春

2）一种猪眼肌面积性状相关蛋白及其编码基因与应用（CAV3基因），完成人：李奎、赵书红

3）一种猪眼肌面积性状相关蛋白及其编码基因与应用（SDHD基因），完成人：李奎、赵书红

4）一种检测猪肉质性状胴体性状的方法（MNTF1基因），完成人：李奎、赵书红

5）Sequence, polymorphisms, and marker test technology for disease resistance (NFKB1), Application no. 60660124 (美国)。完成人: Christopher K Tuggle, Zhao Shuhong (赵书红)，Marnie Mellencamp，John Bastiaansen, Lucina Galina

发表论文

1) Ma Guojian, Huang Jing, Sun Nunu, Zhu Mengjin, Wu Zhenfang, Zhao Shuhong(通讯作者), Molecular characterization of porcine GBP1 and GBP2 genes. Molecular Immunology, 2008, doi:10.106/J.molimm (Eu ahead of print). IF = 4.768

2) Zhao SH, Recknor J, Lunney JK, Nettleton D, Kuhar D, Orley S, Tuggle CK. Validation of a first-generation long-oligonucleotide microarray for transcriptional profiling in the pig. Genomics. 2005, 86(5):618-25. IF =3.558

3) Ting-Hua Huang, Bin Fan, Max F. Rothschild, Zhi-Liang Hu, Kui Li, Shu-Hong Zhao(通讯作者), MiRFinder: An improved approach and software Implementation for genome-wide fast microRNA precursor scan, BMC bioinformatics, 2007 Sep 17;8(1):341. IF = 3.617

4) Zhengmao Zhu, Yong Li, Delin Mo, Kui Li and Shuhong Zhao（通讯作者）. Molecular characterization and expression analysis of the porcine caveolin-3 gene. Biochemical and Biophysical Research Communications，2006, 346: 7-13IF = 2.855

5) Shu-Hong Zhao, Daniel Kuhar, Joan K. Lunney, Harry Dawson, Catherine Guidry, Jolita J. Uthe, Shawn M. D. Bearson, Justin Recknor, Dan Nettleton, Christopher K. Tuggle. Gene expression profiling in Salmonella Choleraesuis infected porcine lung using a long oligonucleotide microarray. Mammalian Genome. 2006, 17: 777-89 IF = 2.279

6) Zhao SH, Simmons DG, Cross JC, Scheetz TE, Casavant TL, Soares MB, Tuggle CK, PLET1 (C11orf34), a highly expressed and processed novel gene in pig and mouse placenta, is transcribed but poorly spliced in human.Genomics. 2004, 84(1): 114-25. IF =3.558

7) Feng Z, Tang ZL, Li K, Liu B, Yu M, Zhao SH (通讯作者). Molecular characterization of the BTG2 and BTG3 genes in fetal muscle development of pigs. Gene. 2007 Nov 15;403(1-2):170-177. IF =2.721

8) Zhu Z M, Zhang J B, Li K, Zhao S H（通讯作者）. Cloning, mapping and association study with carcass traits of the porcine SDHD gene. Animal Genetics. 2005, 36, 191-195. IF =1.520

9) S.-H. Zhao, D. Nettleton, W. Liu, C. Fitzsimmons, C.W. Ernst,N. E. Raney, and C. K. Tuggle*，Complementary DNA macroarray analyses of differential gene expression in porcine fetal and postnatal muscle.Journal of Animal Science. 2003. 81:2179–2188 IF =1.983

10) Zhou QY, Huang JN, Xiong YZ, Zhao SH (通讯作者). Imprinting analyses of the porcine GATM and PEG10 genes in placentas on days 75 and 90 of gestation. Genes and Genetic Systems, 2007, 82:265-9.

11) Feng Y, Huang TH, Fan B, Zhao SH (通讯作者). Mapping of six miRNAs expressed in porcine skeletal muscle. Anim. Genet. 2008, 39:91-92

12) Qiu H,Zhao S, Yu M, Fan B, Liu B.Expression patterns and subcellular localization of porcine (Sus Scrofa) lectin, galactose-binding, soluble 1 gene. Acta Biochim Biophys Sin. 2008, 40(1):85-90.

13) Jing Yu, Quanyong Zhou, Mengjin Zhu, Changchun Li, Bang Liu, Bin Fan,Shu-Hong Zhao（通讯作者）. The Porcine FoxO1, FoxO3a and FoxO4 Genes: Cloning, Mapping, Expression and Association Analysis with Meat Production Traits. Asian-Australasian Journal of Animal Sciences, 2007, 20: 627-633

14) Feng Z, Zhou QY, Ma GJ, Li K, Zhao SH (通讯作者). Mapping of porcine BTG1, BTG4, TOB2, USP2 and PEG3 using somatic cell and radiation hybrid panels. Anim Genet. 2007 Oct;38 (5):536-7.

15) Zhu M，Zhao S (通讯作者). Candidate Gene Identification Approach: Progress and Challenges. Int J Biol Sci 2007; 3:420-427.

16) Chen-Chang XU, Quan-Yong ZHOU, Li-Jie SU, Chang-Chun LI, Shu-Hong ZHAO, Imprinting Analysis of the MEST Gene in 75 and 90 Day Placentas and Prenatal Porcine Tissues, Acta Biochimica et Biophysica Sinica, 2007, Aug;39(8):633-9.

17) Jing Huang, Zheng-Mao Zhu, Shu-Hong Zhao (通讯作者)SNP detection, Imprinting, and Expression analysis in prenatal skeletal muscle of the Porcine Succinate Dehydrogenase Complex, Subunit D (SDHD) Gene. Research Journal of Animal Science, 2007, 1: 102-106

18) Li X, Zhu Z, Mo D, Wang H, Yang S, Zhao S, Li K. Comparative molecular characterization of ADSS1 and ADSS2 genes in pig (Sus scrofa). Comp Biochem Physiol B Biochem Mol Biol. 2007 Feb 1; [Epub ahead of print]

19) Tang Z, Li Y, Wan P, Li X, Zhao S,Liu B, Fan B, Zhu M, Yu M, Li K. LongSAGE analysis of skeletal muscle at three prenatal stages in Tongcheng and Landrace pigs. Genome Biology, 2007,8::R115

20) Uthe JJ, Royaee A, Lunney JK, Stabel TJ, Zhao SH, Tuggle CK, Bearson SM. Porcine differential gene expression in response to Salmonella enterica serovars Choleraesuis and Typhimurium. Molecular Immunology, 2007 Mar 2; [Epub ahead of print]

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29) 彭中镇，刘榜，赵书红，朱猛进。大型猪AI中心与育种值的跨群比较。猪业科学，2007， 5：66-69

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