【NLP】基于TF-IDF和KNN的模糊字符串匹配优化

机器学习初学者

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 ·

2021-05-29 13:41

作者 | Audhi Aprilliant

编译 | VK
来源 | Towards Data Science


在处理真实数据时,最大的问题主要是数据预处理。
匹配可能是许多分析师面临的最大挑战之一。例如,当我们谈论乔治·华盛顿和G·华盛顿时,当然,我们谈论的是一个人,即美国的第一任总统。幸运的是,研究人员已经开发出了概率数据匹配算法或众所周知的模糊匹配。
研究表明,94%的企业承认有重复的数据,而且这些重复的数据大部分是不完全匹配的,因此通常不会被发现


什么是模糊字符串匹配?


概率数据匹配,通常称为模糊字符串匹配,是一种算法或计算技术,用于寻找与模式近似(而不是精确)匹配的某些字符串。
概率数据匹配中的概率明确指示输出必须是概率(在0到1的范围内或相似度的百分比),而不是精确的数字。
有很多方法可以执行模糊字符串匹配,但是随着数据大小的增加,它们的性能会受到很大的影响,例如Levenshtein距离。原因是每个记录都要与数据中的所有其他记录进行比较。
随着数据大小的增加,执行模糊字符串匹配所花费的时间呈二次增长。这种现象被称为二次时间复杂度。二次时间复杂度表示一种算法,其性能与输入数据的平方大小成正比。
随着数据的增长,对速度的需求也在增长。


TF-IDF和KNN如何加速计算时间?


词频-逆文档频率(TF-IDF)是一种自然语言处理(NLP)技术,用于测量文档集合中一个单词对文档的重要性。
例如,从一个文档集合中,单词“flower”有多重要?TF-IDF值与单词出现的次数成比例增加(术语频率),但随着包含该单词的文档数量减少(与文档频率相反)。
IDF部分有助于解释这样一个事实,即某些词通常更常见(例如单词“The”没有任何信息)。
TF-IDF是使用n个字母组来实现的,这些字母组可能是由拼写错误或打字错误引起的。例如,independence这个词被分成以下形式,取决于n的个数。
1-gram
['independence']
2-gram
['in','nd','de','ep','pe','en','nd','de','en','nc','ce']
3-gram
['ind','nde','dep','epe','pen','end','nde','den','enc','nce']
因此,n-gram是从用于字符串匹配的字符串列表中创建的。
TF-IDF背后的思想是,它将文档表示为数据,并且选择用k最近邻和余弦相似度,而不是Levenshtein距离(插入、删除或替换)匹配。
余弦相似度是一种相似性度量,可用于比较文档,或者根据给定的查询词向量给出文档的排序。x和y是两个比较的向量。用余弦度量作为相似函数,我们得到
之后,最匹配的候选数据将与主数据进行比较。它的目的是计算主数据中最匹配的候选字符串之间的相似度。

让我们来练习一下

对于本例,我将通过从Room Type Kaggle数据来演示TF-IDF模糊字符串匹配方法
https://www.kaggle.com/leandrodoze/room-type
老实说,我选择这个数据是因为:(1)数据非常小,只有103行,(2)列表示要比较的混乱字符串和主字符串。在实际情况中,这两种数据(杂乱的和干净的)可能来自不同的来源。
请先运行下面的命令,使用TF-IDF和KNN创建一个模糊字符串匹配函数。
# 导入数据操作模块
import pandas as pd
# 导入线性代数模块
import numpy as np
# 导入模糊字符串匹配模块
from fuzzywuzzy import fuzz, process
# 导入正则表达式模块
import re
# 导入迭代模块
import itertools
# 导入函数开发模块
from typing import Union, List, Tuple
# 导入TF-IDF模块
from sklearn.feature_extraction.text import TfidfVectorizer
# 导入余弦相似度模块
from sklearn.metrics.pairwise import cosine_similarity
# 导入KNN模块
from sklearn.neighbors import NearestNeighbors

# 字符串预处理
def preprocess_string(s):
    # 去掉字符串之间的空格
    s = re.sub(r'(?<=\b\w)\s*[ &]\s*(?=\w\b)''', s)
    return s

# 字符串匹配- TF-IDF
def build_vectorizer(
    clean: pd.Series,
    analyzer: str = 'char'
    ngram_range: Tuple[int, int] = (14)
    n_neighbors: int = 1
    **kwargs
    )
 -> Tuple:

    # 创建vectorizer
    vectorizer = TfidfVectorizer(analyzer = analyzer, ngram_range = ngram_range, **kwargs)
    X = vectorizer.fit_transform(clean.values.astype('U'))

    # 最近邻
    nbrs = NearestNeighbors(n_neighbors = n_neighbors, metric = 'cosine').fit(X)
    return vectorizer, nbrs

# 字符串匹配- KNN
def tfidf_nn(
    messy, 
    clean, 
    n_neighbors = 1
    **kwargs
    )
:

    # 拟合干净的数据和转换凌乱的数据
    vectorizer, nbrs = build_vectorizer(clean, n_neighbors = n_neighbors, **kwargs)
    input_vec = vectorizer.transform(messy)

    # 确定可能的最佳匹配
    distances, indices = nbrs.kneighbors(input_vec, n_neighbors = n_neighbors)
    nearest_values = np.array(clean)[indices]
    return nearest_values, distances

# 字符串匹配-匹配模糊
def find_matches_fuzzy(
    row, 
    match_candidates, 
    limit = 5
    )
:

    row_matches = process.extract(
        row, dict(enumerate(match_candidates)), 
        scorer = fuzz.token_sort_ratio, 
        limit = limit
        )
    result = [(row, match[0], match[1]) for match in row_matches]
    return result

# 字符串匹配- TF-IDF
def fuzzy_nn_match(
    messy,
    clean,
    column,
    col,
    n_neighbors = 100,
    limit = 5, **kwargs)
:

    nearest_values, _ = tfidf_nn(messy, clean, n_neighbors, **kwargs)

    results = [find_matches_fuzzy(row, nearest_values[i], limit) for i, row in enumerate(messy)]
    df = pd.DataFrame(itertools.chain.from_iterable(results),
        columns = [column, col, 'Ratio']
        )
    return df

# 字符串匹配-模糊
def fuzzy_tf_idf(
    df: pd.DataFrame,
    column: str,
    clean: pd.Series,
    mapping_df: pd.DataFrame,
    col: str,
    analyzer: str = 'char',
    ngram_range: Tuple[int, int] = (13)
    )
 -> pd.Series:

    # 创建vectorizer
    clean = clean.drop_duplicates().reset_index(drop = True)
    messy_prep = df[column].drop_duplicates().dropna().reset_index(drop = True).astype(str)
    messy = messy_prep.apply(preprocess_string)
    result = fuzzy_nn_match(messy = messy, clean = clean, column = column, col = col, n_neighbors = 1)
    # 混乱到干净
    return result
请将数据保存在特定的文件夹中,这样我们可以很容易的加载到jupyter上。
# 导入计时模块
import time

# 加载数据
df = pd.read_csv('room_type.csv')

# 检查数据的维度
print('Dimension of data: {} rows and {} columns'.format(len(df), len(df.columns)))

# 打印前5行
df.head()
在这种情况下,Expedia将成为混乱的数据,而Booking.com将成为干净的主数据。为了清楚地理解,我将演示如何运行代码并显示结果。
# 运行模糊字符串匹配算法
start = time.time()
df_result = (df.pipe(fuzzy_tf_idf, # 函数和混乱的数据
                     column = 'Expedia'# 混乱数据列
                     clean = df['Booking.com'], # 主数据(列表)
                     mapping_df = df, # 主数据
                     col = 'Result'# 可以自定义
            )
end = time.time()

# 打印计算时间
print('Fuzzy string matching in {} seconds'.format(end - start))

# 查看模糊字符串匹配的结果
df_result.head()
该算法只需要0.050秒就可以将103行杂乱数据与103行主数据进行比较。
它可以在你自己的更大的数据上运行。但是当我们使用Levenshtein距离时,计算过程有多长?
我们必须进行比较,以确保TF-IDF和k -最近邻能够有效地提高计算时间。


与Levenshtein 距离的比较


对于本教程,我制作了一个与前一个函数具有类似输入和输出的函数(与TF-IDF和k近邻进行模糊字符串匹配)。
首先,运行以下代码来实现Levenshtein距离模糊字符串匹配。
# 导入数据操作模块
import pandas as pd
# 导入线性代数模块
import numpy as np
# 导入模糊字符串匹配模块
from fuzzywuzzy import fuzz, process
# 导入二分搜索模块

def stringMatching(
    df: pd.DataFrame,
    column: str,
    clean: pd.Series,
    mapping_df: pd.DataFrame,
    col: str
    )
:

    # 创建vectorizer
    categoryClean = clean.drop_duplicates().reset_index(drop = True)
    categoryMessy = df[column].drop_duplicates().dropna().reset_index(drop = True).astype(str)

    categoryFuzzy = {}
    ratioFuzzy = {}
    for i in range(len(categoryMessy)):
        resultFuzzy = process.extractOne(categoryMessy[i].lower(), categoryClean)
        # 映射
        catFuzzy = {categoryMessy[i]:resultFuzzy[0]}
        ratFuzzy = {categoryMessy[i]:resultFuzzy[1]}
        # 保存结果
        categoryFuzzy.update(catFuzzy)
        #保存比率
        ratioFuzzy.update(ratFuzzy)

    # 创建列名
    catCol = col
    ratCol = 'Ratio'
    # 合并结果
    df[catCol] = df[column]
    df[ratCol] = df[column]
    # 映射结果
    df[catCol] = df[catCol].map(categoryFuzzy)
    df[ratCol] = df[ratCol].map(ratioFuzzy)
    return df
现在,是时候使用Levenshtein距离实现模糊字符串匹配算法了!
# 运行模糊字符串匹配算法
start = time.time()
df_result = (df.pipe(stringMatching, # 函数和混乱的数据
                     column = 'Expedia'# 混乱数据列
                     clean = df['Booking.com'], # 主数据
                     mapping_df = df, # 主数据
                     col = 'Result'# 可以自定义
            )
end = time.time()

# 打印计算时间
print('Fuzzy string matching in {} seconds'.format(end - start))

# 查看模糊字符串匹配的结果
df_result.head()
与使用TF-IDF和KNN的模糊字符串匹配算法相比,Levenshtein距离需要1.216秒,长24.32倍。
需要注意的是,这个计算时间将随着数据的数量而增加。在这里了解更多关于TF-IDF和Levenshtein距离计算时间的比较。
https://medium.com/tim-black/fuzzy-string-matching-at-scale-41ae6ac452c2


结论


对于小数据,Levenshtein距离(fuzzy-wuzzy模块)是执行模糊字符串匹配的好选择。然而,随着数据大小的增长,计算时间也会增加。
另一种方法是使用TF-IDF结合k近邻和n-gram的NLP技术来查找匹配的字符串。FAISS和HSNW是其他的一些算法,可以用来提高寻找最近邻居的性能。

参考文献


[1] J. Han, M. Kamber, J. Pei. Data Mining: Concepts and Techniques (2012). Elsevier Inc.
[2] C. van den Berg. Super Fast String Matching in Python (2019). https://bergvca.github.io/2017/10/14/super-fast-string-matching.html.
[3] E. Elahi. Fuzzy Matching 101: Cleaning and Linking Messy Data Across the Enterprise(2019). https://dataladder.com/fuzzy-matching-101/.
[4] A. Pearl. Fuzzy String Matching with TF-IDF (2019). https://adrianpearl.github.io/fuzzystring.html.

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