生信宝典

大家好，本次分享的文献是美国斯坦福大学Elizabeth S. Sattely和英国约翰英纳斯中心（JIC）Anne Osbourn联合团队发表在Science上的文章，题目为“Complex scaffold remodeling in plant triterpene biosynthesis”

药用植物因其潜在的抗肿瘤、抗炎和抗氧化特性，在民族医学和传统医学中引起了极大的关注。基因组测序和合成生物学的最新进展重新激发了人们对这些天然产物的兴趣。尽管有很多药用植物的基因组和转录组测序数据，但缺乏可公开访问的基因注释和表格格式的基因表达数据，这不利于它们的有效利用。为了解决这一紧迫问题，我们开

中国科学院微生物研究所（http://www.im.cas.cn）是隶属于中国科学院的科研事业单位，成立于1958年12月3日，目前已成为国内外规模最大的国立综合性微生物学研究机构之一。研究所坚持“微生物、高科技、大产业”的战略定位。以病原微生物与免疫、微生物资源、微生物技术为主要研究领域，设有微生

毕桂萁博士毕业于中国海洋大学，2019年9月至2024年4月在中国农业科学院深圳基因组研究所从事博士后研究。他专注于植物复杂基因组的解析及其重要生物学问题的挖掘，并作为第一作者或共同第一作者在多个国际期刊上发表了多篇研究论文，包括Nature Plants (2024)、Journal o

8月16–18日，2024年度GPB组学与生物信息学前沿研讨会（GPB Omics & Bioinformatics Frontiers Symposium 2024；简称GFS2024）在成都举办。此次研讨会由国家生物信息中心主办，Genomics, Proteomics & Bi

9 月 4 日，教育部党组书记、部长 怀进鹏在《学习时报》发表署名文章，《深化教育综合改革为加快建设教育强国提供强大动力》，在“统筹推进教育科技人才体制机制一体改革”中表述如下：科技创新靠人才，人才培养靠教育。全会明确提出，教育、科技、人才是中国式现代化的基础性、战略性支撑，这一重要论断，体现了以习

在线平台BIC (https://www.bic.ac.cn/BIC/#/, 点击阅读原文或百度搜索皆可访问到)是 ImageGP的重构升级版，重构于2020年初。该平台采用配置文件快速部署工具、生成结果或结果报告。其绘图和分析基于 R 语言(ImageGP 包, 在早期ImageGP脚本的基础上重

◆◆冷泉港亚洲学术会议◆◆Computational Biology of the GenomeOctober 21-25, 2024Abstract deadline: September 6, 2024地点 苏州工业园区独墅阁冷泉港亚洲学术中心会议将于2024年10月21日星期一晚7:

2024年9月4日，华大生命科学研究院联合山东大学、英国东安格利亚大学、中国海洋大学、厦门大学、丹麦哥本哈根大学等机构，在国际顶尖学术期刊 Nature 上发表了题为：Global marine microbial diversity and its potential in b

 点击蓝字 关注我们 iMeta 期刊 第3卷第4期 正式发布iMeta第3卷第4期封面：鸭肠道宏基因组鸭肠道宏基因组。封面图片的灵感来源于俗语“赶鸭子上架”。本研究由浙江省农业科学院肖英平研究员及其合作者首次构建了相对全面的鸭肠道微生物基因目录和宏基因组组装

相信一定有好多同学在心中呐喊：我已经会R语言和统计了，我数据都准备好了，p值都显著了，我可就差漂亮的科研图表了，不想买一本R语言语法书看啊！很多时候我们都需要从头开始学这些。虽然我们有科研能力，但是市场上专门服务这个小类别的在《科研论文配图绘图指南——基于R语言》之前，似乎很少。所以今天看到这个就特

iMeta 被引超4200次，发文210篇，平均引用20，百引耗时14天(2024/9/1)根据 Dimensions 网站统计，截止2024年9月1日，iMeta 己发表论文210篇，被引4201次，平均引用20，百引耗时14天！其中，2023年引用1620次。iMeta 从第一篇文章2022年2

细菌/病毒基因组马上上线！福利公告：为了响应学员的学习需求，经过易生信培训团队的讨论筹备，现决定安排扩增子16S分析、宏基因组、转录组的线上/线下同时开课。报名参加线上直播课的老师可在1年内选择参加同课程的一次线下课 。期待和大家的线上线下会晤。目前可以通报的信息：转录组线上/线下开课时间

Genomics, Proteomics & Bioinformatics （GPB） 在线发表了中国科学院北京基因组研究所（国家生物信息中心）题为“GenBase: A Nucleotide Sequence Database”的数据库文章。我们的“要文译荐”栏目很高兴

我们正在做 ImageGP3的升级工作，如果你有兴趣，欢迎添加页尾二维码标识的微信与我们联系，为 ImageGP3 的功能升级、教程写作、宣传推广一起努力！每个人各尽其力，或一起写代码，或一起写教程，或一起推广，或提出自己的建议。作为 ImageGP 的合作作者，集思广益，更好的让 ImageGP

对于学术造假，真的有很多操作让人“叹为观止”。pubpeer爆料过这样一件事，发现8篇论文，不同作者，不同医院，不同癌症种类，不同蛋白表达，愣是完全一样的结果，居然发了8篇论文！而从文章署名来看，从一线医生到主任副主任医师、医院副院长，还有多篇是国家自然科学基金资助，相信此次事件将再次刷新学术论文造

海南大学作物代谢多样性与环境适应性研究创新团队以番茄和玉米等模式作物为研究对象，以代谢组学为切入点，综合运用生物信息学、基因组学、生物化学、分子生物学、细胞生物学等多种手段，致力于代谢组学检测新技术开发，以及作物代谢多样性与环境适应性研究。实验室前期工作发表在Cell、Molecular Plant

药用植物因其潜在的抗肿瘤、抗炎和抗氧化特性，在民族医学和传统医学中引起了极大的关注。基因组测序和合成生物学的最新进展重新激发了人们对这些天然产物的兴趣。尽管有很多药用植物的基因组和转录组测序数据，但缺乏可公开访问的基因注释和表格格式的基因表达数据，这不利于它们的有效利用。为了解决这一紧迫问题，我们开

点击阅读原文跳转完整教案。1 思考题2 R基础2.1 R安装2.2 Rstudio基础2.2.1 Rstudio版本2.2.2 Rstudio安装2.2.3 Rstudio 使用2.3 R基本语法2.3.1 获取帮助文档，查看命令或函数的使用方法、事例或适用范围2.3.2 R中的变量及其初始化2.3

伴随着 iMeta 获得第一个影响因子 23.7 的好开局，iMeta 北京分舵的青年编委们也迎来了第一次线下讨论会暨 iMeta 系列论坛。2024 年 6 月 28 日，凉风习习，晴空万里，在中国中医科学院中药研究所，这个极具特色的科研殿堂，大家齐聚一堂，围绕科研和期刊的未来发展进行研讨。日程安

根据事业单位公开招聘有关规定，结合工作实际需要，我院现面向社会招聘出站博士后。有关事项公告如下：1单位简介●中国林业科学研究院（简称中国林科院）是国家林业和草原局直属的综合性、多学科、社会公益型国家级科研机构，主要从事林草应用基础研究、战略高技术研究、社会重大公益性研究、技术开发研究和软科学研究，着

博士后/访问学者：RNA生物学和植物分子遗传学方向(美国德州农工大学张秀任团队)博士后/访问学者美国德州农工大学（Texas A&M University）生物化学与生物物理系的张秀任教授实验室(http://plantrnasilencing.tamu.edu)招收博士后和访问学者。张教授

我们正在做 ImageGP3的升级工作，如果你有兴趣，欢迎添加页尾二维码标识的微信与我们联系，为 ImageGP3 的功能升级、教程写作、宣传推广一起努力！每个人各尽其力，或一起写代码，或一起写教程，或一起推广，或提出自己的建议。作为 ImageGP 的合作作者，集思广益，更好的让 ImageGP

点击阅读原文跳转完整教案。1 思考题2 R基础2.1 R安装2.2 Rstudio基础2.2.1 Rstudio版本2.2.2 Rstudio安装2.2.3 Rstudio 使用2.3 R基本语法2.3.1 获取帮助文档，查看命令或函数的使用方法、事例或适用范围2.3.2 R中的变量及其初始化2.3

海南大学代谢生物学团队以代谢组学为切入点，综合运用生物信息学、基因组学、生物化学、分子生物学、细胞生物学等多种手段，致力于解析与人类营养健康息息相关的重要代谢途径，并通过生物育种方式培育高营养附加值的作物新品种。实验室前期工作发表在Cell, Nat Genet, Nat Plants, Nat C

哈萨克族的遗传源流与族群融合历史Chang Lei, Jiaojiao Liu, Rui Zhang, Yuwen Pan, Yan Lu, Yang Gao, Xixian Ma, Yajun Yang, Yaqun Guan, Dolikun Mamatyusupu, Shuhua Xu, An

近日，浙江大学樊龙江教授课题组联合华大生命科学研究院等研究团队在国际知名期刊Developmental Cell 发表了题为”Spatiotemporal transcriptomic landscape of rice embryonic cells during seed germination

小麦是最主要的全球性粮食作物之一，是人类获取能量和营养的重要来源。普通小麦是基因组大小约为15Gb的异源六倍体，其基因组和遗传育种研究极其复杂，被誉为作物界的“珠穆朗玛峰”。面对当前全球人口不断增长、环境气候复杂多变和小麦新品种培育的遗传增益效应逐渐减缓等一系列挑战，科学家亟需找到一条高效、精准的小

第十一届“数学、计算机与生命科学交叉研究”青年学者论坛一 会议简介   “数学、计算机与生命科学交叉研究”青年学者论坛自2013年创办，旨在加强从事“数学、计算机与生命科学交叉研究”青年学者之间的联系，交流生命科学与计算生物学研究领域的最新成果，了解相关国内外发展动态和

细菌/病毒基因组马上上线！福利公告：为了响应学员的学习需求，经过易生信培训团队的讨论筹备，现决定安排扩增子16S分析、宏基因组、转录组的线上/线下同时开课。报名参加线上直播课的老师可在1年内选择参加同课程的一次线下课 。期待和大家的线上线下会晤。目前可以通报的信息：转录组线上/线下开课时间